Thời ông giữ cương vị Chính trị viên Tỉnh đội Quảng Ngãi, năm 1963, địch đánh phá ác liệt. Bộ đội rất đói. Có lần bếp ăn của Ban Tham mưu-Chính trị nuôi được hai con vịt để dành Tết, quý hơn vàng. Nhưng lúc này, một đơn vị đặc công mới từ Bắc vào ăn uống rất kham khổ. Chính trị viên Đoàn Y Thanh bàn với cơ quan Tỉnh đội tặng một con vịt cho bạn. Mọi người tuy có “quyến luyến” của để dành nhưng vẫn vui vẻ nhường nhịn. Còn đồng chí chỉ huy đơn vị đặc công là Trà Thanh Lợi khỏi phải nói mừng đến mức nào. Sau này, gặp lại ông vẫn còn nhắc mãi. Lại có lần trên đường đi công tác xa, mệt rã rời và đói nên ông ghé thăm một đại đội. Vì quý Chính trị viên nên cán bộ ở đây nấu hẳn một lon gạo. Ông bắt chỉ huy nói thật tình hình lương thực. Khi biết cả bếp chỉ còn vài lon gạo cho cả đại đội, ông chỉ ăn một chút cơm còn để lại cho anh em.
Chính vì thấu hiểu đời sống bộ đội nên khi được phân công làm Phó chính ủy Cục Hậu cần Quân khu 5 rồi phụ trách hậu cần chiến dịch, ông tham mưu cho Bộ tư lệnh Quân khu và trực tiếp tổ chức ngành hậu cần thành một thế trận liên hoàn, rộng lớn để phục vụ chiến đấu. Hậu cần Quân khu lúc cao nhất có đến 18 tiểu đoàn sản xuất chuyên nghiệp. Đặc biệt năm 1972, khi tổ chức chiến dịch Nam Quảng Ngãi, quân khu đã có trong tay hàng ngàn tấn gạo. Chiến công lớn chưa từng có lúc bấy giờ. Nhờ vậy mà bộ đội của chúng ta đã ăn no, đánh thắng.
Sau chiến tranh, đời sống nhân dân, đặc biệt là đồng bào Tây Nguyên vẫn còn rất khổ cực, thiếu ăn. Ông Đoàn Y Thanh được giao làm Đoàn trưởng Đoàn 331 làm kinh tế, phối hợp với các đoàn kinh tế khác xây dựng đập chứa nước Đăk Uy ở Kon Tum. Vậy là những năm đó, ông ăn nghỉ trên công trường, chỉ huy lực lượng chủ công hàng ngàn người và hàng trăm phương tiện cơ giới cùng các đơn vị bạn làm nên kỳ tích Đăk Uy có sức tưới khoảng 2.500ha cây trồng, tạo nguồn nước sinh hoạt cho hơn 6 vạn dân. Khi Đại tướng Võ Nguyên Giáp vào thăm Đăk Uy, nghe Đoàn trưởng Đoàn Y Thanh báo cáo, Đại tướng hết sức ngạc nhiên và vui mừng, khen: "Mới giải phóng không bao lâu mà các cậu đã làm quá giỏi".
Thiếu tướng Đoàn Y Thanh mất ở tuổi 91, ông đã để lại bao thương tiếc về lòng nhân hậu, luôn vì đời sống của bộ đội và nhân dân những năm tháng khó khăn nhất.
HÀ MI